משרד הבריאות הכליל את החיסון נגד HPV לתוכנית החיסונים הלאומית, וממליץ לנערים ונערות תלמידי כיתה ח' להתחסן.
יש לכך שתי סיבות עיקריות:

1. מחקרים מראים כי תגובת המערכת החיסונית טובה יותר בקרב אנשים צעירים, בהשוואה לאנשים מבוגרים. חיסון בגיל צעיר יבטיח הגנה חיסונית מיטבית.

2. החיסון עובד בצורה הטובה ביותר כאשר הוא ניתן לפני החשיפה הראשונה לווירוס, כלומר - לפני תחילת הפעילות המינית. הסיכוי להידבק קיים כבר בפעם הראשונה שבה מקיימים יחסי מין, לכן כדאי להתחסן עוד טרם תחילת הפעילות המינית.

כ- 80% מהאוכלוסייה הבוגרת, גברים ונשים כאחד, יידבקו לפחות בזן אחד של הווירוס במהלך חייהם. בקרב גברים, עלול הווירוס לגרום לסרטן הפה והלוע, לסרטן פי הטבעת, לסרטן הפין וכן ליבלות באברי המין.

וירוס הפפילומה הוא אחד הווירוסים הנפוצים ביותר בעולם.
ברוב המקרים, מערכת החיסון תצליח להיפטר מהווירוס, אך אם הווירוס יישאר בגוף, ימשיך להתרבות וההדבקה תהיה ממושכת - הוא עלול לגרום לתחלואה טרום-סרטנית , סרטן או יבלות בקרב גברים ונשים כאחד.

החיסון נגד וירוס הפפילומה נועד על מנת למנוע הדבקה עתידית בזנים שכנגדם הוא מגן, ובכך להפחית את הסיכוי לחלות במחלות השונות להן עלול לגרום הווירוס. הזנים שכנגדם מגן החיסון אחראים לרוב המחלות להן עלול לגרום הווירוס. החיסון אינו מטפל בהדבקה קיימת.
בדיקות הסקר (פאפ/ HPV test) לעומת זאת, נועדו לזיהוי מוקדם של הדבקה קיימת בווירוס ו/ או של נגעים טרום-סרטנית ובכך עשויות למנוע גידול סרטני בצוואר הרחם.

החיסון מורכב רק מחלבונים המדמים את חלבוני המעטפת של הווירוס, ובניגוד לווירוס עצמו - החיסון לא מכיל את החומר הגנטי ולכן אינו יכול לגרום למחלות להן עלול לגרום הווירוס.

שימוש בקונדום יכול להפחית את הסיכון להידבק בווירוס, אולם יש לזכור כי גם כאשר נעשה שימוש נכון בקונדום - הווירוס עלול להדביק אזורים שאינם מכוסים על ידי הקונדום, כך שלמעשה, קונדום לא מקנה הגנה מלאה מפני הידבקות בווירוס הפפילומה. כמו כן, הגבלת מספר בני/ות זוג עשויה להפחית את הסיכון להידבק בווירוס.

80% מהאוכלוסיה הבוגרת יידבקו בזן אחד לפחות של הנגיף במהלך חייהם.

החיסון הראשון נגד וירוס הפפילומה אושר לשימוש בשנת 2006. בשנת 2017 הגדיר ארגון הבריאות העולמי את החיסון נגד וירוס הפפילומה כ"חיסון בטוח ביותר לשימוש". הגדרה זו ניתנה על סמך למעלה מ-270 מליון מנות של חיסונים נגד וירוס הפפילומה שניתנו ברחבי העולם.

מחקרים אשר בחנו את הקשר בין התחסנות כנגד HPV ומתירנות מינית מצאו כי התחסנות כנגד HPV בגילים צעירים לא הובילה לעלייה בסבירות לקיום מגע מיני ראשון, או לירידה בגיל קיום יחסי מין בפעם הראשונה, ואף לא לעלייה במספר בני/בנות הזוג עימם התקיים מגע מיני, בקרב נערים ונערות.

התפתחות תחלואה הקשורה לווירוס הפפילומה מעידה על כך שלא מתפתחת אצל אותו אדם תגובה חיסונית טובה מספיק בשביל להתמודד עם הזיהום ולכן היא/הוא בסיכון לסבול מתחלואה חוזרת עקב חשיפה נוספת לווירוס. מחקרים הראו כי החיסון נגד וירוס הפפילומה יעיל בהפחתת סיכון לתחלואה חוזרת, אשר נגרמת על ידי הווירוס, ולכן החיסון יכול להועיל גם למי שהייתה לו בעבר תחלואה הקשורה לווירוס.